दिल्ली एनसीआर समेत समूचा उत्तर भारत प्रदूषण से जूझ रहा है, लेकिन आगरा मेट्रो इस समस्या को हल करने की दिशा में काम कर रही है। हालांकि, मेट्रो निर्माण के दौरान धूल के कारण प्रदूषण में वृद्धि हो रही है, फिर भी यूपीएमआरसी इस पर प्रभावी नियंत्रण बनाए हुए है।