कॉलेज के प्रिंसिपल डॉ. अनुराग शुक्ला के खिलाफ पिछले साल जून से जांच का सिलसिला चल रहा है। लगभग 17 महीने बाद उच्च शिक्षा आयोग ने उनका अभ्यर्थन (एप्लीकेशन) शून्य घोषित किया। अब उच्च शिक्षा निदेशक ने उनके चयन को निरस्त कर आगरा कालेज का प्राचार्य पद रिक्त घोषित कर दिया है।